癌梗六边形是菌株的安乐窝。这个结论来自于对1000多个各不相同人类此前列腺癌的样品的严格数据分析。这项由魏茨曼科学知识数据分析所(Weizmann Institute of Science)领袖的数据分析挖掘出,从大脑到骨骼先到卵巢癌,所有此前列腺癌型式的梗六边形中都都假定着菌株,甚至还挖掘出了每种此前列腺癌中都都假定着独特的菌株动物集合。
数据分析表明,明白癌梗六边形和它的"微型菌种分组"密切关系的关系确实有助于预测某些疗程的潜在有效性,或者确实为今后操纵这些菌株以增强抗病毒疗程的作用指明方向。这项数据分析的结果刊发在Science周刊上。
几年此前,该数据分析所分子梗六边形生物学系的Rid StraussmanDr挖掘出了潜伏在人类十二指肠梗六边形内的菌株;这些菌株被证明可以通过"消化"和灭活这些药剂来受保护癌梗六边形易受化疗药剂的侵扰。 当其他数据分析也在梗六边形中都挖掘出菌株时,Straussman和他的开发团队欺骗这样的宿主是否确实是一种游戏规则,而不是例外。 为了寻找解答,Straussman课题分组的Deborah Nejman和Ilana LivyatanDr以及复杂该系统电学管理工作的Garold FuksDr与国外的生物学家和数据分析医务人员一起工作。这项工作也由以色列政府开放的大学数学和计算机科学知识系的Noam ShentalDr领袖。
最终,该小分组展开了一项详梗的数据分析,以高分辨率描述 这些此前列腺癌中都的菌株便是都有大脑、骨骼、、肺、卵巢、十二指肠、结肠直肠和黑色素瘤。他们挖掘出,从大脑到骨骼的每一种此前列腺癌都有菌株,各不相同的此前列腺癌型式有各不相同的菌株大类。
然而,卵巢癌的菌株使用量和多样性最高。数据分析小分组证明,与正常卵巢外面的分组织相比,在卵巢中都可以挖掘出更多的菌株,而且一些菌株应将在分组织中都挖掘出,而不是在外面的正常分组织中都。 为了想得到这些结果,开发团队需克服几个挑战。首先,样品中都的菌株使用量相比较大,数据分析医务人员需寻找步骤来之外都数据分析这些梗六边形内的或多或少梗六边形。
他们还需消除任何确实的外部污染源。为此,他们常用了数百个阴性对照,并创建了一系列的计算滤网,以清除任何确实来自样品外部的菌株的踪迹。 该开发团队能够直接从人类卵巢中都培养菌株,他们的结果证明,在这些中都挖掘出的菌株是活的。这些菌株的电子显微镜显示,它们更喜欢在癌梗六边形内的特定位置便是临近梗六边形核。 各不相同的梗六边形有各不相同的菌株 数据分析小分组还报告说,菌株不仅假定于癌梗六边形中都,还假定于内的病原体中都。
Straussman说:"这些菌株中都的一些才会增强抗病毒免疫反应,而另一些才会减缓这种反应便是这一挖掘出确实与明白某些免疫疗法的有效性除此以外无关。"事实上,当数据分析小分组相当了来自黑素瘤样品分组的菌株后,他们挖掘出对免疫疗程有反应和反应较差的黑素瘤中都有各不相同的菌株富集。
Straussman相信,这项数据分析还可以暗示为什么有些菌株喜欢癌梗六边形,以及为什么每种此前列腺癌都有自己的典型菌种集合:歧异显然归结于在每种梗六边形生态中都都有的生态。
理论上,菌株确实倚赖某些生物合成产物生存环境,这些生物合成产物是由特定的产生的或储假定特定的中都。例如,当数据分析小分组将前列腺癌肺中都挖掘出的菌株与从未吸过口含的病症的菌株展开相当时,他们挖掘出了歧异。 当数据分析医务人员相当这四支菌株的基因时,这些歧异更加显著:前列腺癌肺癌梗 六边形中都的基因有更多的基因来生物合成尼古丁、、苯酚和其他在口含雾中都挖掘出的有毒。
除了显示一些最常见的癌梗六边形中都独特的菌株动物集合外,数据分析医务人员相信,他们所开发的步骤可以用来回答一些关于这些菌株塑造成的片中都的近期:是菌株吃掉癌梗六边形的结余一氧化氮,还是为梗六边形都有一个咨询服务?它们在什么之前居住于?它们如何促进或阻碍此前列腺癌的生长?
它们对各种抗病毒疗程的反应有什么严重影响?
"是一种复杂的生存环境生态,除了癌梗六边形、病原体、游离梗六边形、血管、大脑和其它成分外,所有这些都是我们所说的微生态的分组成部分。
我们的数据分析,以及其他实验室的数据分析,吻合地表明,菌株也是微生态的一个分组成部分。"Straussman说:"我们希望,通过察觉到它们如何确切地适合于一般的生态,我们可以察觉到疗程此前列腺癌的新步骤。"
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